永明元年（公元483年，癸亥年）
春季正月辛亥日，皇上到南郊举行祭祀仪式，之后宣布大赦天下，并更改年号。还下诏说，因为边境安宁，管理百姓的官员，全都恢复田地俸禄。
让太尉豫章王萧嶷兼任太子太傅。萧嶷不参与朝廷日常事务，但经常悄悄给皇上出谋划策，皇上大多都采纳了。
壬戌日，皇上封皇弟萧锐为南平王，萧铿为宜都王，皇子萧子明为武昌王，萧子罕为南海王。
二月辛巳日，任命征虏将军杨炅为沙州刺史，并封其为阴平王。
辛丑日，封宕昌王梁弥机为河、凉二州刺史，邓至王像舒为西凉州刺史。
刘宋末年的时候，觉得管理百姓的官员任期六年太久，就改成三年一任，叫做“小满”。但实际上官员的升迁调动，又不能按照三年这个规定来。三月癸丑日，皇上下诏：“从今往后，全都以小满（三年任期）为标准。”
有关部门因为天文现象失常，请求举行祭祀消除灾祸。皇上说：“顺应天命要靠实际行动，而不是表面文章。我约束自己，努力把国家治理好，一心想着推行惠民政策。要是灾祸是我造成的，祭祀消除又有什么用！”
夏季四月壬午日，皇上下诏说：“袁粲、刘秉、沈攸之，虽然他们最后晚节不保，但最初的忠诚还是值得肯定的。”下令都按照礼仪重新安葬他们。
皇上当太子的时候，觉得自己年纪大，又和太祖一起开创了帝业，所以朝廷里不管大事小事，经常擅自做主，很多都违反了制度。他特别信任身边的张景真，这张景真骄横奢侈，穿的衣服、用的东西，都仿照皇上的规格，朝廷内外的人都怕他，没人敢说。司空咨议荀伯玉，向来被太祖亲近厚待，他感叹说：“太子做的这些事，皇上始终都不知道，我哪能因为怕死，就不让皇上了解情况呢！我不报告，还有谁去报告！”趁着太子去拜谒皇陵的时候，荀伯玉就偷偷把这些事告诉了太祖。太祖听了很生气，下令调查东宫。
太子拜陵回来，到方山的时候天晚了，正准备停船休息，豫章王萧嶷从东府乘坐飞燕船往东去迎接太子，把太祖发怒的事情告诉了他。太子夜里回到宫中，太祖也没睡，关着宫门等着他。第二天，太祖让南郡王萧长懋、闻喜公萧子良传达旨意，责备太子，还把张景真的罪状拿给他看，让太子以自己的名义去抓张景真，然后杀掉。太子又担心又害怕，就称病不起。
过了一个多月，太祖的气还没消。有一天白天，太祖躺在太阳殿，王敬则直接走进来，给太祖磕头说：“皇上您得到天下的时间不长，太子平白无故被责备，大家心里都很害怕。希望皇上能到东宫去安抚一下太子。”太祖没说话。王敬则就大声宣布旨意，让人准备去东宫，又命令太官准备饭菜，喊着左右的人找轿子，太祖还是没什么反应。王敬则拿了衣服给太祖披上，硬是把太祖拉上了轿子。太祖没办法，只好去了东宫，还在玄圃召集各位王爷一起宴饮。长沙王萧晃举着华盖，临川王萧映拿着雉尾扇，闻喜公萧子良端着酒器，南郡王萧长懋给大家斟酒，太子和豫章王萧嶷、王敬则亲自捧着酒菜伺候。一直到晚上，大家都喝得大醉才回去。
太祖很赞赏荀伯玉的忠诚，对他越发亲近信任，很多军事机密和国家大事，都交给他去办，他的权力大得能影响朝廷官员。荀伯玉母亲去世的时候，离他家还有二里左右，路上就已经挤满了来吊唁的官员的车马。左率萧景先、侍中王晏一起去吊唁，从早上等到晚上，才好不容易轮到他们上前。等出来的时候，又饿又累，连说话的力气都快没了，心里的气愤都表现在声音和表情上。第二天，他们对太祖说：“我们看到东宫和皇宫的门口，跟荀伯玉家比起来，都可以张网捕鸟了（形容人少）。”王晏是王敬弘的侄子。
骁骑将军陈胤叔，之前也向太祖报告过张景真和太子的一些事，但跟太子说的时候，都说“是荀伯玉报告给皇上的”。太子因此对荀伯玉怀恨在心。
太祖暗地里有让豫章王萧嶷取代太子的想法，但是萧嶷对太子更加恭敬谨慎，所以太子对他的友爱之情也没有减少。
豫州刺史垣崇祖不怎么亲近依附太子，正好垣崇祖打败了北魏的军队，太祖把他召回朝廷，和他秘密商议事情。太子对这件事起了疑心，就对垣崇祖格外客气，对他说：“外面的流言蜚语，我已经不放在心上了。从今往后，我的富贵就跟你绑在一起了。”垣崇祖赶紧下拜感谢。后来太祖又派荀伯玉去传达关于边境事务的敕令，让他接到命令后连夜出发，都没来得及向太子告辞。太子觉得垣崇祖对自己不真诚，就更加记恨他了。
太祖临死前，还特意把荀伯玉托付给太子。皇上即位后，垣崇祖多次升迁，做到了五兵尚书，荀伯玉也多次升迁，做到了散骑常侍。荀伯玉心里一直担忧害怕，皇上因为荀伯玉和垣崇祖关系好，担心他们会发动变故，就表面上对荀伯玉很安抚。丁亥日，皇上下诏诬陷垣崇祖勾结江北的不法之徒，想和荀伯玉一起作乱，把他们都抓起来杀了。